藤原拓海由于不败的战绩，必然会受到新的挑战。《头文字D》的第二部着重突出拓海的成长，当然不乏激烈的挑战。最经典的要数赤诚和依吕波山路两位老大的比拼。年轻的拓海在爱情上触了礁，在输给帝王车队的lanEvo 3后，拓海遇到了人生的挫折，对自己和AE86产生了怀疑，AE86真的有足够的实力吗？AE86的重生来自拓海的爸爸文太，他为AE86改装了赛车用引擎。同时，拓海遇到了同样是AE86的强劲对手秋山涉。有意思的是比赛规则是在同一赛道两车来回追赶，直到其中之一能超越对方为止，既要技术又考耐力。胜利让拓海继续接受这辆AE86和重拾信心回到车手的生涯。
这个洋馆里有一个秘密——伫立在悬崖边上的巨大洋馆「影宅」中模仿着贵族们生活着的，没有脸的一族人「影子」。以及作为影子的“脸”而存在并侍奉他们的「活人偶」。某一日，“影子”的少女凯特的住处，有一位“活人偶”来访。“影子”与“人偶”的不可思议的日常生活就此开始。
