故事发生在以音乐为中心、次文化兴盛的涩谷，与能映射出人们内心“真正的心愿”的「世界」中。某天，一直用音乐给人们带去力量的虚拟歌手初音未来，发现自己的歌声无论怎样都无法传达出去……而一群在「世界」中追寻音乐梦想的少年少女们与初音未来相遇，共同寻找着可以让初音未来“将歌声传达出去”的方法。
一位传奇的驯狗师相信他可以把 Marmaduke 从一只不守纪律但惹人喜爱的狗训练成第一只赢得世界狗狗锦标赛的大丹犬。
本片由5万8千张实拍照片组成，耗时6年，是一部表现女性题材的国产纯手工定格动画长片在一个不允许女鞋怪物工作的男鞋世界里，因害怕女鞋怪物体内蕴藏的植物原力，新生的女鞋必须立即执行变性手术变为男鞋投入生产。一只被关押在监狱里的高跟鞋妈妈为了不让自己即将出生的女儿被变性，逃出监狱并杀死了男鞋监狱长，她把监狱长的尸体做成一件男鞋皮囊，伪装成男鞋进入男鞋世界里工作。一次意外暴露身份后，她遭到无尽的折磨与打击，最终发现了体内蕴藏的植物原力，于是踏上为女复仇的道路……
2050 年的首尔，宇航员兰英的终极目标是登陆火星，但她未能通过第四次火星探险计划的最终考验。音乐家杰伊将梦想埋葬在一家古董音响店里。两人在一次偶然的相遇后坠入爱河。他们互相鼓励，憧憬着新的未来。兰英再次获得了前往火星的机会，这正是她一直以来的愿望。“别忘了，在这片浩瀚太空中，总有人在为你默默加油。”
日本著名造船公司八代商船设计制造了旗下第一艘豪华邮轮爱芙罗黛谛号，为庆祝该邮轮的处女航，八代商船邀请各界名流参加，上到首相下到富豪悉数前来。铃木园子的父母也接到邀请，因行程安排铃木夫妇无法出席，园子于是邀请、毛利小五郎、小兰、柯南等一众好友同行。蓝天白云，美酒佳肴，众人无不陶醉于这美好的假期之中。 但是，这注定是一次不寻常的航行。先是园子突然遭人绑架，接着八代商船的女社长贵江被人杀害，与此同时董事长八代延太郎也从船上神秘失踪。此前不久，贵江的丈夫八代英人驾车时突发心脏病冲下山崖。这一连串死亡、失踪案件似乎都与15年前八代商船的沉船事故有关。在层层推理调查之下，隐藏的秘密渐渐浮出水面…
一只古老的面具打破了神秘世界族民们的平静的生活，一场不可避免的战争即将爆发！为阻止这场战争，新族长啦啦请人类世界的好友王雨果回来帮忙，淘气的雨果却将爸爸王大山带入了神秘世界。面对周遭突如其来的变化和对未知的恐惧，爱女心切的王大山惊慌失措，糗态百出……鬼马精灵的女侠、包子脸怪兽啦啦、帅气呆萌的老爸、率直娇憨的熊大叔；个性迥异的卖萌组合，欢乐逗趣的神秘历险，悬念迭起的旅程即将起航！
22接到游戏公司邀请，参与他们研发的虚拟现实游戏《盒中海》试玩。游戏世界里的南方沿海渔村，村民们把各家各户供奉的神像请上街来“游神”庆贺元宵。22和其他3名测试玩家发现一位未曾见过的女性神明“慈舟圣姑”。随着深入探查“慈舟圣姑”的来历，他们逐渐发现来自游戏外的人为篡改痕迹，有一个神秘的力量在潜移默化影响游戏里的npc。另一方面，22的妹妹33也在游戏外发现员工的蹊跷行为。居心叵测的公司企业、悄悄策划神秘仪式的npc渔民、还有似乎各怀秘密的同伴。一个多方势力交织的巨大阴谋渐渐浮出海面。
西宫硝子（早见沙织 饰）生来患有听觉障碍，要依靠助听器和外界交流，口语发音也因此格外的古怪。小学时，硝子转入了一所新的学校，特殊的生理缺陷让她成为了班上引人注目的独特存在，她因此收获了坚实的友情，却也遭到了以男生石田将也（入野自由 配音）为首的小团体的孤立和排挤。随着时 间的推移，无心或有意的恶作剧渐渐升级，最终演变成为了无法挽回的伤害，硝子永远的消失在了众人的眼前。
运气绝佳的小樱（丹下樱 配音）在买文具时，抽中了特等奖，去往香港的旅行。这个意外之喜让小樱极其兴奋。最后商讨出的结果就是小樱、知世（岩男润子 配音）、桃矢（关智一 配音）及雪兔（绪方惠美 配音）四人一起去香港游玩。四人到达香港后，小樱捕捉到了奇怪的气息，一直尾随着四人。在追逐的过程中，小樱意外与小狼（熊井素子 配音）和莓玲（野上尤加奈 配音）相遇。四人于是被小狼带回了家作客。小樱在小狼家做了奇怪的梦，事后被小狼的母亲占卜，告知原因是因为小樱强大的力量易招引魔力，且告知小樱要警惕水。梦中的景象似乎是预告，而这次香港之行似乎冥冥之中被谁操控着…
穷酸秀才小破孩进京赶考，路遇“彪悍女侠”、江湖骗子、冷酷杀手等人，引出一系列啼笑皆非、荒唐无语的故事，一路有惊无险，竟然考中了大状元。随后，小破孩凭借非凡的绝学，收编了一彪人马杀奔古城洛阳，破获一个“天大”的奇案。
延续TV版的主线剧情，继续讲述从战场回来的少女薇尔莉特·伊芙加登为了理解“爱”的含义而从事为有需要的人们写信传情的工作。薇妹一直挂念的少佐的下落大概率会在这部剧场版中讲述。
高一那年夏天，帆高（醍醐虎汰朗配音）离开位在离岛的家乡，独自一人来到东京，拮据的生活迫使他不得不找份工作，最后来到一间专门出版奇怪超自然刊物的出版社担任写手。不久，东京开始下起连日大雨，仿佛暗示着帆高不顺遂的未来，在这座繁忙城市里到处取材的帆高邂逅了与弟弟相依为命，不可思议的美少女阳菜（森七菜配音）。「等等就会放晴了喔。」阳菜这样告诉着帆高，不久，头顶的乌云逐渐散去，耀眼的阳光洒落街道……原来，阳菜拥有「改变天气」的奇妙能力……
