乌森之地有着不可思议吸引妖怪的力量，凡是接近那儿的妖怪，都会得到强大的力量而急剧进化、变强，年幼时，因为良守同情一只妖怪，而使它产生变化，就在千钧一发之际，时音救了他，却也因此受了严重的伤，良守非常自责，下定决心要变的更强，保护时音.然而结界师所要面临的危险远不是他想的那么简单。
“强殖装甲”是数万年以前降临地球的外星人留下的超生体兵器，平凡的高中生深町晶偶然间得到卡巴，他的同校学长卷岛颚人则得到了另一套。因此成为了秘密组织克诺斯狙击的对象。此后，二人将要面对神秘组织克诺斯所派出兽化兵的追杀。渐渐的，关系到人类起源与未来的秘密变得清晰起来
龙墟界域，广袤无垠，宗门林立。羽神宗独占东方一隅，传承了无尽岁月，强者无数，难以撼动。门中设有天灵院，搜罗各处的天才少年加以培养，为宗门不断输送掌握妖兽力量的妖灵师。少年聂离，由羽神宗外门执事引荐，前往天灵院修行。在天灵院，聂离与神秘少女应月茹相遇。少女掌握了能够演算天机的天衍禁术，预感到羽神宗将会在各大家族的争权之中走向分崩离析的结局，而怀有赤子之心的聂离就是唯一能阻止这一切的天选之人。两人因此成为师徒，聂离必须在应月茹的指点下一步步登上羽神宗宗主之位。
