《魔笛奇遇记》讲述了一个充满悬念的少年英雄冒险的故事，美国加利福尼亚威尼斯海滩上的一个十几岁的普通男孩，由于偶然的机会，成为了一份可怕遗产的继承人，这份遗产是一支已经沉睡了3000年并具有无限魔力的笛子。
故事发生在一个名为帕帕拉宿的奇幻国度之中，六年级的女孩梦川唯（伊达朱里纱 配音）一直渴望着能够成为一名偶像，然而，成为偶像对于一个平凡的女孩子来说是一件多么可望而不可及的事情啊，虽然所有人都质疑梦川唯的梦想，但她始终坚信，只要不断的努力，总有一天可以将梦想实现。某日，帕帕拉宿竟然开张了偶像主题公园美妙天堂，传闻中超级偶像真中啦啦（茜屋日海夏 配音）也要前来助阵。个性活泼开朗，非常擅长运动的虹色妮诺（大地叶 配音）、风格酷炫特立独行的学姐幸多美知留（山田唯菜 配音）、嗜钱如命的华园秀香（朝日奈丸佳 配音），霎时间，一大批可爱的偶像涌现了出来。
在该剧中，居然还有一个专门负责人力资源的常规角色（Amber Nash配音）。这在同类动画中非常少见。
日本东北地区的某座深山里，国中生小町在一间祭拜熊的神社中，担任巫女的重责大任。有一天，小町对监护人，也就是名为那津的熊说：“我想去念都市的高中。”为了能够让不经世事的小町，拥有在都市中生活的基本能力，那津展开了一连串的试炼，要求小町通过考验。
二阶堂明本来是个笑起来很阳光的男孩，很受欢迎。但初中一次意外事件，给他留下了严重的心理创伤。上高中后，他整个人变得死气沉沉，也不与人打交道，犹如从伊藤润二漫画中走出的男子，传闻跟他搭话就会变成秃头。大家对他避之不及，但偏偏有人不信邪，要去找他搭讪……
劳尔（河本启佑 配音）自小就立志成为一名勇者，并且为了实现理想而付出了大量的努力和汗水，尽管周围的人都将劳尔看作是胡言乱语的怪人，但这并没有阻止劳尔追逐梦想的脚步。然而，就在他即将取得勇者测验合格证的前夕，竟然出来了魔王被打倒的消息，勇者制度亦因此被废除，这也就意味着，勇者劳尔，失业了。身心都遭受了巨大打击的劳尔变成了家里蹲，并在汹涌而来的就业潮中好不容易得到了在魔术店莱昂王都店打工的职位。让劳尔没有想到的是，一位名为菲诺（田所梓 配音）的女孩成为了她的同事，而菲诺的正是身份，竟然是魔王的女儿。
