蛇妖许黑诞生灵智后，因偷食陈家镇的猪闯入猪圈，恰巧遇上被混混扔进来、后被仙人夺舍重生的陈凡。许黑误将陈凡当作可怕的捕蛇人，情急之下吞了他，却没想到陈凡在其腹中不仅没死，还试图夺取他的妖核。一番争斗后，许黑妖核破裂、身受重伤。危急时刻，陈凡的妖族至宝妖神鼎意外吸收了许黑的妖核碎片，反将陈凡吞噬。最终，许黑在光效作用下身体逐渐修复，倒影化作蛟龙。
开学第一天，普通高中生五河士道（岛崎信长 配音）如常来到学校，不料遭遇了突如其来的“空间震”现象。同学们纷纷躲进避难所，士道想起与妹妹（竹达彩奈 配音）的约定，他不顾危险跑到街道上，却遇到一个穿着盔甲手持大剑的神秘美少女（井上麻里奈 配音）。美少女正要攻击他时，同班同学鸢一折纸（富樫美铃 配音）率领着AST部队，与她展开了激烈的战斗。随后士道被带入空中舰艇，他惊讶地发现司令官竟然是自己的妹妹！他还得知那名少女是“精灵”，一直以来困扰着人类世界的空间震现象，正是这种精灵造成的。要对付精灵，除了出动部队赶尽杀绝以外，还有另外一种方法，而这种方法只能依靠士道。那就是与精灵约会，感化她，让她爱上这个世界，爱上人类。平凡少年五河士道，能不能攻略这个绝美精灵少女？
进入《迷宫饭》弱肉强食的世界，不想被吃，就要勇敢开吃。
