主角云舒在一个绵延了十年的大梦中捡到一个残破的世界，从而开始了他震惊世人的崛起之路。云舒本身天赋异禀，却因为怪病十年不入修行门槛，受尽欺辱。在这个残破的世界中，他获得了取之不尽的灵草、用之不竭的精矿，以及一具和他一模一样的身体，身上还携带着重宝。凭借这些无尽的机缘，云舒走上了逆天地、定轮回、再造乾坤的道路。
前作中以三号机驾驶员巴武藏的牺牲为代价，终于打败了恐龙帝国，但又出现了由有角人类构成的百鬼帝国也要征服世界。补充了新驾驶员車弁慶及新机器盖塔G的早乙女研究所又投入了战斗。
作品主角是不太会拿捏与他人之间距离、身材娇小的阿波连同学，以及目标是「交到一百个朋友」、坐在阿波连同学邻座的来堂同学。两人之间的距离以掉在地上的橡皮擦为契机而急速接近，一场青春恋爱喜剧便由此开始。
被撤职的锦衣卫袁小棠与青梅竹马的方雨亭为寻找父亲失踪的线索潜入鬼街、在朋友石尧山等人的帮助下，一路逛鬼街、破机关、遇各路神秘人物……乱斗与阴谋轮番上演，随着旧事的重提，一切谜团都渐渐有了答案。
