他，国民级游戏天外江湖中的传说，“全球争霸赛第一人”“亿万玩家的精神领袖““第一帮派领导者”......鲜衣怒马少年得意之时，惨遭背叛，走下神坛逃离游戏世界，从此消失匿迹。 多年后，一个自称来报恩的少年出现了......
继《迪迦奥特曼剧场版:最终圣战》的故事时间之后火星移民计划启动，人类纷纷登陆火星和其他领域。新的GUTS——SUPER GUTS成立了，并替代了原GUTS。 转眼间7年过去了，人类取得了巨大的突破，开始了对多种未知世界的开拓。地球人怀着单纯的憧憬以及无限的探求心，向太空进发，人们将此称为新领域的时代。但与此同时，一些新的可怕力量也都苏醒过来。 本作的主人公飞鸟信，是在光中消失的宇航飞行员飞鸟一马的儿子。当时的飞鸟信还和他的父亲约定回来看他打棒球，在此时他却从戴民长官那里得知了噩耗。
许多年过去，地球在Z战士的保卫下日渐和平与繁荣。某天，皮拉夫大王和他的爪牙历经千辛万苦来到神殿，找到了神仙与比克大魔王分身前制造的黑星龙珠。由于孙悟空的突然出现，皮拉夫慌忙之中许下让孙悟空变成少年模样的愿望。在此之后，黑星龙珠散落到宇宙各个角落，如果在一年之内无法找到七颗黑星龙珠的话，地球将会爆炸毁灭。情况危急，小悟空和孙女小芳开始了一段惊险刺激的宇宙大冒险。超级17号、邪恶龙等强大的对手接连出现，悟空面临更大的挑战……
