这一年是天保十一年（1840年）。有一次，大饥荒爆发，人们心神不宁，于是恶魔们便化身为人，愚弄世人。角野是距离江户市区较远的一个山村。这个村子里住着一对兄妹，分别是仁太和铃音。两人是年幼时因为某种原因来到葛野的陌生人，但却被大家所接受，和谐地度过了在一起的日子。村子里有一位名叫“Itsukihime”的巫女，随着 Jinta 的成长，他成为了她的保镖。然后有一天，当仁太在森林中执行打败恶魔的任务时，他遇到了一个谈论遥远未来的神秘恶魔。身为巫女的贴身护卫，仁太时常处于死亡边缘，而铃音虽然担心哥哥，却仍开朗勇敢地送他离开。正当白哉履行着巫女“一木姬”的职责时，他的生命却受到了恶魔的威胁。三个人的命运齿轮交叉在一起，发生了偏差。一场大灾难降临到人魔身上，影响了整个时代很长一段时间。从江户到平成。一部日式史诗奇幻小说，讲述一个恶魔穿越 170 年间，不断质疑挥舞剑的意义的故事。
哈洛克 (S-00999)、大山藤一郎 (S-00998) 和艾梅拉达斯 (X-00001) 乘坐阿卡迪亚号逃离被侵略者伊鲁米达斯占领的地球。随后，他们被列入全宇宙通缉名单，通缉代号为 SSX，尽管遭到了 Illumidas 军队的攻击，他们仍然与包括外星人 La Mime 在内的同伴一起继续旅程，寻找他们认为存在于宇宙某处的乌托邦“阿卡迪亚”。战斗中，地球男孩物野忠、女孩利威尔和雪萤加入了队伍，班博士则担任船医。另一方面，伊路米达斯地球占领军命令年轻的天才科学家佐恩先生对阿卡迪亚号进行分析和调查，以建造一艘超越阿卡迪亚号的飞船。佐恩先生也踏上了前往阿卡迪亚的太空之旅。
