少年兔武士 Yuichi 是伟大战士宫本兔的后裔，他踏上了成为一名真正武士的史诗般的征程。
在平行世界的日本，铁道国有化根深蒂固。就读于桐生铁道高中的高山直人（福山润 配音）梦想进入国铁担任火车司机，从此过上安安稳稳的生活。为此他进入学生铁道OJT参加培训，并在此结识了性格过激的暴力女樱井葵（沼仓爱美 配音）和头脑简单四肢发达的岩泉翔（日野聪 配音）等人。好不容易通过了OJT的测试，结果直人他们却被分配到了东京中央铁路公安室第四警戒班。原来国铁长期赤字，许多地方线路长期废弃。为此有很多组织以极端的手段要求国家将铁路实现民营化，于是铁道公安队应运而生。直人他们成为铁路上不可或缺的重要存在……
距离我们上次见到武士杰克已经过去了 50 年，时间对他并不仁慈。阿库摧毁了每一个时间门户，杰克停止了衰老，这是时间旅行的副作用。他似乎被诅咒了，只能永远在这片土地上游荡。他的过去一直困扰着他，还有一群刺客为了阿库的荣耀而致力于杀死他。
