在一个架空世界里，有一小群秘密存在着的“特殊能力者”，简称特能人。他们不会在普通人面前暴露自己，并通过一个自治组织——异控局，对各种特能造成的非自然事件进行管理，维护社会秩序。然而随着时间推移，特能人之间也出现了立场分化。有人想要守护和平维持平衡，有人想利用特能攫取私利。矛盾，一触即发。
“自从来这里以后，我就不用再背负生活的重担。或许正因如此，我才能真正地全力以赴。”欢迎来到这座位于热带岛屿的宝可梦度假村，新手礼宾员春绘与伙伴可达鸭携手迎客，与前来度假的宝可梦共度一段美好温馨的成长时光。春绘（能年玲奈 配音）已逐渐摆脱新手的青涩，与可达鸭一同接待海 魔狮、小猫怪、伦琴猫、风速狗、龙虾小兵等许多新的宝可梦开心入住。春绘与这群贵宾相处得轻松又愉快，偶尔才有突发状况需要处理。某天，一个名叫肯特（町田启太 配音）的男子出现了，而他似乎是春绘的前男友。他为什么会来 ？他与春绘的关系又会如何发展？除此之外，泰勒的叔叔丹（山路和弘 配音）也带着与他相伴15年的海魔狮来度假，只是他时而露出落寞的神情，好像在烦恼什么事情……
该季讲述了，拥有“武神躯”的少年镇魂将一一曹焱兵为寻父母下落，与少女夏铃、北落师门等队友，闯入灵域禁地芦花古楼，并与守卫者“风花雪月”四王展开激烈交锋的冒险故事。
