在被暗影侵蚀的星源大陆，唯有心灵纯粹、未被污染的孩子仍保有光明。来自迷雾镇的三位少年——勇敢的小途、执着追梦的小望、温柔守护的阿坚，被星光之力选中，与光精灵灵灵结伴踏上前往星光城的冒险之旅。他们一路闯过奇幻险境、直面内心软弱，以团结与信念对抗暗影魔王，最终唤醒人心、重燃世界光明。在搞笑的奇幻冒险的旅途中，故事以成长为主线，传递勇气、梦想、爱、坚持与友情五大正向价值观，让孩子在笑声中学会直面恐惧、坚守热爱、懂得关爱与守护他人、永不放弃、珍惜伙伴。真正的光，不在远方。在你心里。
天外陨石引发全球海啸与红雾变异，海洋沦为吃人炼狱。幸存者林渊遭女友背叛、被“好兄弟”抛弃，却在绝境中觉醒SS级基因能力“机械主宰”，可拆解万物升级载具。他从破木筏起步，一路猎杀海兽、血洗海盗、解构沉船升级为导弹驱逐舰，以现代重火力碾压畸变怪物与异教徒。
阳城大学一夜之间被黑雾笼罩，校园变成充满考验的生存之地。顾清寒意外觉醒特殊天赋，成为隐藏在暗处的班长。面对失控的规则、恐惧的人群和接连不断的危机，她没有选择逃避，而是用智慧守护同伴、重建秩序。青梅竹马陆清宴始终陪在她身边，用勇气和信任为她挡下危险。两人带领同学团结协作，在一次次考验中学会责任、牺牲与坚持，也让冷漠的校园重新找回温度。当黑暗试图吞噬所有希望时，他们选择并肩向前，用善意凝聚力量，用行动证明：只要彼此守望，就没有无法战胜的困境。
继《迪迦奥特曼剧场版:最终圣战》的故事时间之后火星移民计划启动，人类纷纷登陆火星和其他领域。新的GUTS——SUPER GUTS成立了，并替代了原GUTS。 转眼间7年过去了，人类取得了巨大的突破，开始了对多种未知世界的开拓。地球人怀着单纯的憧憬以及无限的探求心，向太空进发，人们将此称为新领域的时代。但与此同时，一些新的可怕力量也都苏醒过来。 本作的主人公飞鸟信，是在光中消失的宇航飞行员飞鸟一马的儿子。当时的飞鸟信还和他的父亲约定回来看他打棒球，在此时他却从戴民长官那里得知了噩耗。
