故事发生在民国初年，江南望族姚家的少奶奶曾淡云（林韦君 饰）被二奶奶赵翠屏诬陷，被指控她与管家刘子浩（江宏恩 饰）有私通关系。曾淡云怀孕的身体遭到了姚家家法桃花烙的处罚。刘子浩好心相救，并将曾淡云带回了他的老家，介绍给自己的妻子宝春认识。曾淡云在刘子浩的陪伴下顺利分娩，生下了一个女婴，而同一天，宝春却遭遇难产，产下一个儿子后就离世了。多年后，赵翠屏得知曾淡云的下落，并错误地认为刘子浩的儿子是姚家的后代，于是强行夺走了孩子，将其改名为姚靖石（霍政谚 饰）。曾淡云的女儿念慈也被沈家收养，改名为沈雁容。
自那之后已经过去了5年。Amazon几乎被驱除，世界趋于和平。但是被Amazon细胞感染的普通人Amazon化的现象在持续发生扩大，为此政府组成了新组织4C，秘密驱除Amazon化的人类。其中，幼年时期被Amazon养大的少年·千翼变身假面骑士Amazon Neo与Amazon战斗。但在被生来的吃人冲动所驱使的他的面前出现的是，变身为乌鸦Amazon并作为生物兵器战斗的少女·优。对于这样的优，他第一次没有产生“想吃”的想，并被她吸引着。而优的真面目是被Amazon化的父亲杀死后，作为Sigma型而复活的Amazon。
程浩（吴镇宇 饰）、姚家成（温兆伦 饰）和杨志彪（陶大宇 饰）是生活在同一个村庄的不良少年，三人整日厮混在一起，日子过得浑浑噩噩但也充满了快乐。终于，胡作非为惯了的三人捅了篓子，程浩自愿出头，为姚家成和杨志彪顶罪，最终进入了少年感化院。 程浩的义气感动了姚家成，他发誓从此不再乱来，好好做人，可是，杨志彪却并不这么想，恰恰相反，他的坏事越做越大，最终成为了毒贩，三人就此分道扬镳，不再联系。出狱后的程浩，无论是感情还是事业都十分不顺，一次偶然中，他同杨志彪重逢了，一拍即合之下，两人走上了运毒贩毒的不归之路。
一直希望靠小聪明获得成功的马进，事业和爱情屡屡受挫，甚至将自己的希望都寄托在他人身上。在一次公司集体活动中，一行人遭遇意外流落至荒岛，从此众人的命运发生了翻天覆地的变化。
一场换心手术让少女夏早安获得双重人格，拥有推理能力的隐藏人格——爱迪生，牵引着夏早安进入了一系列连环杀人阴谋中。推理天才米卡卡为帮助好友夏早安找出隐藏在爱迪生人格身后的秘密，与其组成了校园天才破案二人组。同学被绑架、班主任被杀、奇怪又神秘的学长齐木，看似毫无关联的零碎线索竟穿成了一条线，凶手直指名为“扑克牌”的神秘组织。扑克牌是什么组织？为何执行这场连环谋杀？爱迪生的真实身份又是谁？谜团的背后还有谜团，真相不止一个。
