十五年前，丁晓前世在与白衣古神的旷古决战中殒没。十五年后，丁晓七岁结灵胎，特招入镇灵司，却被判定为废相而沦为背棺人，八年来受尽冷眼。镇灵司分为八部，而灵部与归部夙怨颇深。机缘之下，丁晓觉醒了相力，在考核赛中成为了归部的英雄，也成为了灵部的眼中钉。与此同时，各地起煞事件越来越频繁。为救妹妹丁灵的怪病，丁晓再次踏上了度化灵煞的征途，随后被卷入到一场惊天阴谋之中，幕后黑手也渐渐浮出水面，而这一切似乎与丁灵的怪病有关。
鱼住陆生（小林亲弘 配音）是一个无论是长相还是性格都非常普通的男人。大学毕业之后，陆生并没有削尖了脑袋想要挤进大企业里，而是选择去便利店成为了那里的一名打工人，所有人都对陆生的选择表示不解，但陆生脑中有着他的算盘。森之目榀子（花泽香菜 配音）在一所高中里担任代课老师的职务，因为曾经的一段悲惨经历，导致榀子紧紧的封闭起了内心，不再接受任何人的关怀。陆生喜欢上了这样的榀子，默默的守候在她的而身边。野中晴（宫本侑芽 配音）是早早就离开了家走上了社会的早熟少女，在机缘巧合之下她喜欢上了陆生，并且知晓了他对榀子的感情。
电视动画《圣痕炼金士》改编自吉野弘幸原作、佐藤健悦作画的同名漫画。在漫画杂志《Champion RED》2009年7月号（2009年5月19日发售）上，发表了《圣痕炼金士》TV动画化的消息。电视动画于
