《超级变形警长救援队 第2季》是面向4-6岁低幼儿童打造的启蒙成长类续作动画，延续第一季冒险暖心基调，升级剧情、救援场景与角色设定，打造兼具趣味冒险、安全科普与品格启蒙的全新故事篇章。
末世降临，流浪的秦枫占领了一片能自己长出武器和弹药的神奇农场。他救下了被曙光基地赶出的灵岚、阿青、小禾三个女孩，面对曙光基地篡位者赵海和铁壁基地独裁者霍振武的侵略，秦枫等人依托神奇农场的出产，一次次将敌人打退。不但粉碎了坏人们夺取农场的阴谋，更是联合星云基地击毙了霍振武和赵海。最终，秦枫带领三个女孩回到曙光基地，从此农场也不再种植武器而成了人类复兴的火种。
菜穗（花泽香菜 配音）是一名普通的高中二年级女生，过着波澜不惊的平淡生活。一天，菜穗收到了一封神秘的信件，寄件人竟然是10年后的自己，10年后的菜穗声称自己的生命中发生了无法挽回的巨大遗憾，为了弥补这个遗憾所以才寄出了这封穿越了时空的信件。刚开始，菜穗只是将这封信当成是一个恶作剧，但第二天，信中所提及的那个叫做成濑翔（山下诚一郎 配音）的男生竟然真的转学到了菜穗的班上，按照信里所说，菜穗将会喜欢上翔，而翔则会在17岁那年的冬天死于非命。菜穗该怎样做才能够避免这一悲剧的发生呢？
