架空战国时代的日本被未知生命体“鬼神”统治已有150年，唯有“武士团”反抗其统治，一直不懈抗争。武藏和小次郎也曾向往着武士，发誓有朝一日结成最强的武士团。可是，他们所生活的城镇却将鬼神奉为神明，将武士视为异端。武藏只能将梦想藏在心中，直到有一天，他遭遇了人类被鬼残忍杀害的一幕。为了重拾与小次郎的誓言，武藏向强大的鬼发起了挑战…！
习得一身本事的巫医嫡传孙大为下山入世，没有天大的抱负，只想家人健康快乐，自己能够治病救人赚点小钱，却没想到总有麻烦找上自己，面对尘世种种诱惑纠葛，且看一个胖子如何扮猪吃老虎，并将巫医发扬光大。
