令和末期，日本因全球核战影响走向衰败，大量难民涌入，更严重的病毒、大地震、苛政与饥荒接连发生，引发民众暴动，国家体制崩溃，人口锐减至原来的十分之一以下，文明水平倒退至明治初期，并分裂为“大和”“武凰”“圣夷”三国。约一百年后，大和历56年，生于爱媛郡的少年三角青辉登上历史舞台，一段以日本再统一为目标的时代故事由此展开。
《泡泡美人鱼》讲述了三名少女出海游玩时不小心掉入一座神秘古庙中央的水池，被月光照射而变成了美人鱼，从此拥有神奇的魔法，后来她们在朋友的帮助下，凭借勇敢和机智对抗幕后恶势力，保护蓝色海洋环境的故事。
