十万年前，暗中布局万古的任行，在快要摧毁黑暗动乱的那一刻，被亲手培养的六大源神背叛，肉身被废之后，囚于绝境之域，两万年之后，八位大帝强者以身陨为代价，强行救出任行肉身...
在很久以前,大地有一棵名为世界树的圣树,魔王札特为了得到世界树的力量.而不择手段,当时世界上的人民. 包括战士村的怪物.魔法森林的怪物,弓手村的怪物,以及后来因为战争而成了废弃都市的盗贼村.以及人类村的5条村的 人民奋勇作战,可惜,战斗途中,世界树选择了自毁重生,自毁后,把种子散步在世界各地,因为圣树世界树是这个世界的支柱.所以一旦毁灭掉的话就很麻烦,在战斗中途因为发生了意外,人类村的村民被其他村的村民误解,被排挤.说世界树的自毁是人类造成的,这只是故事的开端。 过了10年后...5条村分别由怪物和人类分开管理,因为种族的分歧,而不断修炼,祈求得到世界树种子的神秘力量统治枫之谷,札特军团死心不惜,也加入抢夺行列,主角阿鲁,是曾经参加保护世界树人类英雄的儿子,也因为他的心,也因为札特军团的各种手段,4条村终于和解了。
“自从来这里以后，我就不用再背负生活的重担。或许正因如此，我才能真正地全力以赴。”欢迎来到这座位于热带岛屿的宝可梦度假村，新手礼宾员春绘与伙伴可达鸭携手迎客，与前来度假的宝可梦共度一段美好温馨的成长时光。春绘（能年玲奈 配音）已逐渐摆脱新手的青涩，与可达鸭一同接待海 魔狮、小猫怪、伦琴猫、风速狗、龙虾小兵等许多新的宝可梦开心入住。春绘与这群贵宾相处得轻松又愉快，偶尔才有突发状况需要处理。某天，一个名叫肯特（町田启太 配音）的男子出现了，而他似乎是春绘的前男友。他为什么会来 ？他与春绘的关系又会如何发展？除此之外，泰勒的叔叔丹（山路和弘 配音）也带着与他相伴15年的海魔狮来度假，只是他时而露出落寞的神情，好像在烦恼什么事情……
