实验室爆炸，现代灵魂意外坠入大秦，附身身陷天牢的长公子扶苏。朝堂之上，始皇震怒，因扶苏力护文脉、顶撞君威，将其囚禁。帝王要肃清六国邪书、稳固新政，并非毁典籍，却遭扶苏误解。嬴政下最后通牒：令扶苏亲督整肃，事成则赦，不从则严惩。
天才少年变废柴遭家族排挤，未婚妻竟上门当众退婚；萧炎为雪前耻立三年之约，一句豪言震惊全场：“三十年河东，三十年河西，莫欺少年穷！”在师父药老的帮助下，陨落天才开启了的传奇逆袭之路！
第二部剧情自力石死后矢吹丈终于东山再起开始，到原作的最后与孟德萨拉之战中，矢吹丈“化为白色的灰烬”结束
