神明降临、凡人与神明共存的世界，强者为尊，弱者在战火中挣扎。主角原本是普通人一次意外后拥有了能看到万物血条的神秘能力，这使他在战斗中如同游戏玩家般，能精准把握局势，根据血条制定策略，哪怕面对神明也毫不畏惧。随着能力增强主角发现世界规则复杂
藤原拓海由于不败的战绩，必然会受到新的挑战。《头文字D》的第二部着重突出拓海的成长，当然不乏激烈的挑战。最经典的要数赤诚和依吕波山路两位老大的比拼。年轻的拓海在爱情上触了礁，在输给帝王车队的lanEvo 3后，拓海遇到了人生的挫折，对自己和AE86产生了怀疑，AE86真的有足够的实力吗？AE86的重生来自拓海的爸爸文太，他为AE86改装了赛车用引擎。同时，拓海遇到了同样是AE86的强劲对手秋山涉。有意思的是比赛规则是在同一赛道两车来回追赶，直到其中之一能超越对方为止，既要技术又考耐力。胜利让拓海继续接受这辆AE86和重拾信心回到车手的生涯。
