藤沼悟（满岛真之介 配音）拥有着能够回到过去的特异功能，母亲佐知子（高山南 配音）被害，曾经信赖的朋友白鸟润（水岛大宙 配音）即将作为儿童连续杀人案的真凶被处以死刑，在这个节骨眼上，悟忽然回到了1988年，回到了当时就读的小学。
《泡芙小姐》以每集一个独立且彼此关联的小故事的形式，讲述了繁华都市里时尚男女的情感生活。泡芙小姐，是一名时尚性感的独居白领。她有自己的小小朋友圈——清纯女孩小若、妖娆美女十三妖和潮男超级玛丽。四个人有着不同的处世态度，对爱情也有着不同的理念。
动画以被神秘的外星人德拉克特毁灭了几乎所有人类的地球为舞台展开。过去人类为了躲避外星人而藏身的避难所伊克西亚，毁灭之日的记忆被抹去的居民们什么都不知道地过着普通的生活。但是住民中也有一部分的“被选中的人”们，驾驶着名为罗格的巨大机器人与外星人战斗着……
