第六季中，故事始终以两条叙事线索展开。其中一条，他们在岛上。另外一条，他们也坐过那班飞机，但飞机没有出事，因此每个人都在岛外过着完全不同的生活。戴斯蒙发现两个世界之间的连接点，他于是一个个地去找那些曾经同机的人，用各种极端的方式让他们“回忆”起在岛上那段其实他们并没有经历过的日子。很多从不相识的人因此走到了一起，相爱，幸福地生活在一起。而在岛上，他们早就因种种缘由失去了彼此。最后，杰克在父亲的葬礼上见到这些同伴们幸福的笑脸，他也笑了。一直以来在宿命和责任中挣扎的杰克，在“醒”来的那一刻，真正解脱了。
王初一与刘十五马上要结为儿女亲家，却因为药材联合社诚信经营的事儿剑拔弩张。十五的毁约令初一损失惨重，赔款、退婚、上门女婿也趁机闹起了分家。而十五也没想到一时的见利忘义竟引得妻离女散，两家自此反目。离婚后的十五另立山头，与初一正面交锋，药王村随之掀起一场轩然大波。初一刚要应战不料也后方吃紧：儿子大力要带十五女儿姗姗进城创业；年轻时的恋人如梦讨债上门，自己纠缠在两个女人之间焦头烂额。而笃信在商言商的十五也遇到了大麻烦，险些被不讲诚信的合伙人坑得倾家荡产。危难之时初一伸出援手，十五汗颜。大力、姗姗的婚礼如期举行。一对老冤家也冰释前嫌，药王村一副花繁叶茂的绚丽图景跃然眼前
乡村男孩智贤搬到首尔学习。与此同时，年长的宰元回到了同一所大学。他们开始对彼此产生了好奇心。但当智贤加入宰元参加的同一个冲浪俱乐部时，事情开始升级了。
