动画版《世界毁灭》是由制作过《攻壳机动队》系列的ProductionI.G担当制作。动画版与游戏的基本设定都相同，比如受困于毁灭世界委员会和砂之海之间的这个世界等等。但是女主角莫尔特携带了毁灭世界的秘宝，以及克里埃和莉?嗄分属两个对立组织的成员等，这其中有一部分设定是动画版新追加的。与游戏及漫画展开不同的情节这也正是动画版的魅力所在。动画上映同时，漫画也将于7月开始连载。
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令和末期，日本因全球核战影响走向衰败，大量难民涌入，更严重的病毒、大地震、苛政与饥荒接连发生，引发民众暴动，国家体制崩溃，人口锐减至原来的十分之一以下，文明水平倒退至明治初期，并分裂为“大和”“武凰”“圣夷”三国。约一百年后，大和历56年，生于爱媛郡的少年三角青辉登上历史舞台，一段以日本再统一为目标的时代故事由此展开。
玄都山掌教沈峤一心避世，却无意中卷入江湖纷争，身中奇毒，坠下山崖双目失明，被浣月宗主晏无师救起后，随晏无师游历江湖，逐渐找回失去的记忆，揭开了隐藏在纷繁芜杂事件中的大阴谋。一本武林秘籍的出现搅乱了武林平和的假象，看主人公是否能看破全局修得剑心。
