十万年前，暗中布局万古的任行，在快要摧毁黑暗动乱的那一刻，被亲手培养的六大源神背叛，肉身被废之后，囚于绝境之域，两万年之后，八位大帝强者以身陨为代价，强行救出任行肉身...
美术大学学生竹本和学长真山以及多次留级的森田一起生活在单身公寓里，大家的生活风清云淡却也乐趣无穷。
所谓的“除妖”，即是把由于某些缘由而从原本应在的“隐世”来到“现世”停留的妖怪们送回“隐世”这一工作。某天，被妖怪附体的高中生·芦屋花绘，依靠偶然发现的联络方式，来到了专门除妖的物怪庵，在那里的是一脸不高兴的店主安倍晴斋。由于某些缘故，芦屋就这样以物怪庵奉公人的身份开始工作……安倍与芦屋的除妖组合和妖怪们的物语就此开幕。
衍生诗选类动画剧《劣迹》，讲述《黑袍纠察队》世界中还不为人知的故事。
