因经历过核冬天，在这里人类不再是世界的主宰，物种变异、生存资源稀缺，面对无法预测的未来和环境，危机迭出。人类为了保护自己建造了一座座壁垒，但也有很多人没有进入壁垒生活，在荒野打猎为生。主人公任小粟和弟弟颜六元就是其中之一。并无血缘关系但却相依为命的兄弟二人凭借着他们顽强的意志力不断成长，并在偶然的机会下觉醒了超能力。任小粟为生计和保护家人，离开自己生活的集镇前往境山，一路遭遇狼群、人面虫、变异生物的袭击，觉醒超能力，任小粟能否在危机中逃生...
这一天，班上转来了两个学生，一个是跳级生美滨千代（金田朋子 配音），她拥有着和可爱外表完全不匹配的天才级智商，以及同智商完全不匹配的情商。另一个叫春日步（松冈由贵 配音），她倒是表里如一的迟钝和呆萌。很快，她们便和同学们打成了一片。泷野智（樋口智惠子 配音）人称阿智，争强好斗的同时，却有着意外的单纯和天真。外表冷静成熟的榊（浅川悠 配音）对世上一切可爱的东西抵抗力为零。水原历（田中理惠 配音）是阿智的童年玩伴，成绩优秀的她毫无疑问的成为了阿智的挑战对象。再加上一个活宝班主任谷崎由佳里（平松晶子 配音），这三年的高中生活一定会多姿多彩的。动画片由漫画家东清彦的同名四格漫画改编，用过描绘女子高中生的日常，展现了一个可爱温暖，妙趣横生的世界。
在每一个角落都被探索完毕的世界中，唯一残留的秘境——大洞穴“深渊”。不知道延续到何方，深不见底的巨大纵向洞穴，栖息着奇妙奇怪的生物们，沉眠着现在的人类无法制造的贵重遗物。“深渊”那充满了不可思议的姿态吸引了人们，并驱使人们展开冒险。如此，多次挑战大洞穴的冒险者们，陆续得到了“探窟家”的名号。
“强殖装甲”是数万年以前降临地球的外星人留下的超生体兵器，平凡的高中生深町晶偶然间得到卡巴，他的同校学长卷岛颚人则得到了另一套。因此成为了秘密组织克诺斯狙击的对象。此后，二人将要面对神秘组织克诺斯所派出兽化兵的追杀。渐渐的，关系到人类起源与未来的秘密变得清晰起来
故事以18世纪的欧洲为舞台，在当时的意大利某小镇上，有着日本血统的孤儿天马和喜爱绘画的亚伦是一对挚友。某日亚伦受到大圣堂的神父 ( 睡神修普诺思) 的指引，去到一处被称为“地面上的极乐净土”的地方寻找“真实之红”。在那里亚伦遇到了一个叫“潘多拉”的神秘少女，自此亚伦的身体开始发生了变化。
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