突然出现在人类面前的神秘飞翔体“灾”。意味着灾厄的此一存在凭借异样的战斗力凌驾于所有的航空战力之上。为对抗他们而开发的，便是对现有机体进行特别调整以实现超水准高机动力，被称为“子体”的兵器。负责操控的则是名为“阿尼玛”的操纵机构。它——竟拥有少女的外表。因“灾”的缘故而失去驾驶员母亲的少年“鸣谷慧”，他遇见了闪耀鲜红光辉的瑞典制战斗机以及驾驶它的阿尼玛“格里芬”。身为人类最终兵器却动作不稳定的格里芬，还有一心向往天空的少年，两人漫长且炙热的故事就此展开。
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在偏僻的小村庄——雏见泽村过着愉快生活的少年前原圭一，得知了在这和平村庄中发生的分尸杀人案件。而此事件，又与被称为「御社神的作祟」的一连串离奇死亡案件有所关联。
“章总章总，有个大人物要见你。”正在埋头看文件的章雨抬头瞥了他一眼又低头，才悠悠地问，“哪个大人物要见我？”“顾东阳。”“哦，我还以为什么了不得的大人物呢。 顾东阳，不认识。”章雨漫不经心的说。“我怎么说也跟你同在一个屋檐下住了无数个日夜，你居然说不认识我，是不是非得我做点什么你才能想起我是谁？”
艾拉小镇是一个人与精灵共存的时尚小镇，可可和她的小伙伴们生活在这里，她在这里经营着一家名为LALALACOCO的时尚商店。偶然一天，刚搬来艾拉小镇的小女孩露莉，经过可可的商店，被里面漂亮的服饰吸引进去，原本不善打扮，性格害羞的露莉逐渐认识了可可和可可身边的朋友们，在他们的指点和交流下，原本封闭的心也逐渐敞开，变得越来越有自信。
