青城山灭派，玄门遭遇旷世劫难。朱离地煞觉醒，携青城掌教冷霜凝险夺玄珠，再顾青玉坛，蒙星象子指点，欲共赴昆仑抵御魔道大军。天一子未赴中秋之约，太白子知道天一子已遇不测，开始查探凶手，本以为是魔道的阴谋，没想到在昆仑派发现了一些端倪。魔道势力风谲云诡，其间隐情扑朔迷离，深不可测的魔道高人邓辰因为太初九元的转世，重出天阴谷，纠集紫衣人等魔道长老集齐三才秘要，欲救出魔道祖师天魔元煞，登顶昆仑之时，幕后黑手阴谋乍现，玄魔两派均遭扫荡。玄魔两派，孰正孰邪，灵飞纪第三季为您揭开面纱。
在微光原野的晨光城，鬼点子林小宇、细心的沈遇和力大无穷的陆一，偶然发现一颗发光种子长成通往奇境世界的大树，并获得勇气护符。他们收到求助信，从害怕到勇敢接受使命，用智慧与善意化解风滚草团子、回音蘑菇等小麻烦。奇境核心“愿望之泉”因大家的小情绪堵塞，三人意识到需理解与分享，团结所有朋友，以各自特长和真诚之心疏通泉眼。最终，两个世界温暖相连，三人的友谊与勇气成为最坚固的桥梁。
