新编《济公游记》包括11个弘扬中华文化精髓、净化人心、显现神通的历史故事。该剧以诙谐、幽默、智慧的表现形式，歌颂了人间的真善美，并借以隐喻当今社会所存在的道德问题，是一部寓教于乐，凝聚中国古典佛文化、民族色彩的上佳之作。游本昌先生本着以“演戏要对得起观众”的严谨作风，对剧本精雕细琢，用拍摄30集电视剧的投资，奉献出20集精品。伴着“鞋儿破、帽儿破”的余音，游本昌此次道出“妄心生烦恼，心平万事平，心净万事净”的人生真谛。
1949年初，大批以农村干部为主的解放军部队进入城市。马安山和乔梁是一对异姓兄弟，从小一起长大的富家子弟乔梁对自己奶妈的儿子马安山有救命之恩，两人情同手足。上级任命马安山为临江军管会主任，乔梁为副主任。接管城市后的共产党干部们面临着如何从革命党转为执政党的严峻考验。马安山和乔梁这两个城市管理者产生了冲突。在经历一系列挫折后，马安山在实践中得到了成长。然而城市的稳定，经济的发展造成腐败滋长。总想用自己的才华为国家建功立业的乔梁，一直为自己生活在哥哥马安山阴影下感到沮丧。他在纠结和挣扎之中走向堕落和腐化。乔梁被绳之于法，新城临江也在风雨中重获新生。这是一次血的教训，是在我们党的全新政权建立之初，值得执政者们警醒的城市之路。
菜鸟法医程芷昕（陈晓华饰）几经努力终被调派到恩人林琛（韦家雄饰）手下工作，林琛是法医科内公认最硬核法医，毒舌傲慢兼看不起新人，经常闹爆芷昕。芷昕虽然受尽林琛刁难，却从来没有气馁，更常常表现出独有的法医触觉，先后为「双餸饭碎尸案」及「疑似黑社会仇杀案」找出真相，令林琛开始对她改观…此时重案组警员、有「警界黑仔王」之称的高俊（马贯东饰）被指在追捕犯人期间杀害疑犯，林琛将解剖重任交予芷昕，芷昕不负寄望查出案中有案，令高俊也对其另眼相看…自此，林琛、芷昕、高俊组成铁三角，联手侦破一宗又一宗的迷离凶案。
刑侦队长吴栋在一次执行任务中，恰巧抓到了一个大贩毒团伙的要犯。在激烈枪战中搭档王飞牺牲，上级领导限期侦破，吴栋在层层重压下，投入了紧张、危险的侦破工作，“6?16”案的艰难历程开始了……在线人的帮助下，吴栋等得到了这个团伙毒贩交易的准确情报。追捕过程中被警觉的毒贩谭小蓉觉察，追捕行动失败，但谭小蓉却无意留下了一个手机号。顺着这个线索，吴栋的视线指向了一个神秘的会所??爱心家园。毒品没有出手，谭小蓉、周建平急于用钱，准备马上把从家乡带回的几个年轻女孩“送”出去，其中有谭小蓉的表妹李小梅。李小梅宁死不愿屈服，被周建平打了毒针。李小梅等被贩卖的去处同样也是爱心家园会所。通过手机号联系到了张学平（李小梅的舅舅），并从他那里得到了关于谭小蓉的一些线索，还了解到李小梅失踪在爱心家园。吴栋等正要调查爱心家园，却被领导张广亮的一个电话拦住了。由于张广亮的层层阻挠，吴栋和于鹏等几个弟兄只能暗地调查爱心家园，调查齐玉坤。在雪华那里吴栋了解到，张广亮最近和齐玉坤联系密切，而且张广亮最近的行为有些反常。吴栋无法对雪华说出对张广亮的怀疑，那毕竟是她的哥哥，是她唯一的亲人。于鹏在秘密侦察时候突然被人暗杀。吴栋因此被停职，下派到了派出所。“6?16”案现在由张广亮负责。吴栋没有因此而放弃，已经有两个弟兄搭上了性命，他不能眼看着犯罪分子继续猖狂下去……神密的爱心家园到底是什么背景？张广亮又为何阻拦？警匪两派又掀起了欣然风波……
出身贫苦的马天明遭陷害卷入一桩灭门惨案，逃亡过程中意外顶替了留洋医生蔡里昆的身份藏身于衡山医院。红色商人朱天德手里掌握着一大笔秘密的红色资金，却在躲避敌人追捕时突发急病昏迷不醒，住进了衡山医院。中统、力行社的特务，日本军部，上海青帮等各方势力都对这笔巨款虎视眈眈。因枪击重伤也住进了衡山医院的蔡里昆本人，正是苏区派来接应朱天德的特派员，他让马天明继续维持假身份，二人结盟与各方恶势力周旋。在险象环生的斗智斗勇中，原本一心为财的马天明被革命者蔡里昆的高风亮节所打动，真正成长为一个深晓民族大义的共产党人，最终战胜了恶徒，完成了组织交予的任务，同时也为自己洗清了冤屈。
