本季延续《西行纪》前一季剧情，讲述了唐三藏与师徒四人取得奇经交予天宫的十六年后，为了心中正义，再次集结成“西行小队”，重新踏上“还经”之路的故事。
孤僻内向的刺猬少女苏叶，小时候和完美的男神郑树在学校里不打不相识。从此到高中为止苏叶身边唯一的朋友就是郑树。郑树对谁都微笑礼貌行为成熟，唯独在苏叶面前能展现出无理取闹极其幼稚的模样。 从小到大，苏叶和郑树的关系就像他们的名字一样联系紧密，大树和树叶，好像谁也离不开谁。这份从未被定义的关系，到了真正要定义的时候，反而变得复杂。 不知从何时开始，苏叶对这个朝夕相处的青梅竹马产生了不一样的感觉，两人之间原本熟悉的言语和动作竟令她心跳加速。 明明只是一起长大的朋友，却会因为他恰到好处的动作，羡慕亲吻他掌心的发丝；会因为他忧郁的眼神，嫉妒赖在他脸庞的阳光。然而在苏叶心中，郑树只是把她当成朋友。 喜欢一个人往往容易变得自卑，掩盖了很多事实真相。显而易见的是，郑树早在很久之前就喜欢苏叶了，面对她是那副独一无二的幼稚模样就是最好的证明。所幸这是一段没有错过的感情，故事的过程和结局都是甜的。
故事发生在2017年的地球，飞鸟信（鹤野刚士 饰）的父亲飞鸟一马是一名宇航员，在一次任务之中下落不明，长大后的信继承了父亲对正义的追求，成为了地球和平联合组织的一员，在学习和训练之中展现出了过人的实力，甚至打败了王牌飞行员由美村良（齐藤理沙 饰）。
