深夜，大火，奔涌肆虐的地下之火，无情地吞噬着井下的矿工……救护车警笛声声，溪平不眠，溪平煤矿发生了瓦斯爆炸的惨案，但这起惊天大案却不知为什么在社会中竟无声无息、不为人知、没有一丝一毫的披露……某报著名记者迟立强、杨茗莉应邀为溪平煤矿撰写报告文学，职业的敏感使他们捕捉到溪平煤矿所谓先进达标企业的背后，存在违反安全操作规程，暗地里与矿工签定生死合同的不法内幕。而恰在此时，迟立强的前妻俞静在采访北山矿返城的途中突然意外死亡……
天才少年庄尼进入一家国际职业技术学校学习，天赋异禀、聪明绝顶的他，受到校内外各类人群 关注，收获了大量迷妹，但也因此遭到不少“仇家”嫉恨，遇到各种各样的麻烦，由此引发一系列精彩纷呈的故事。
警视厅音乐队的雨野小梦（广濑爱丽丝饰），某天突然被派往“全领域异常解决室”，通称“全决”。来到外观像神社社务所一样的本部，见到了代理室长兴玉雅（藤原龙也饰）。据兴玉所说，“全决”是从大和朝廷时代开始就存在的世界最古老的搜查机关，是专门搜查超自然现象之类的“不可解事件”的内阁官房直辖机关。只有人的身体在某一天突然消失的“神隐”，像影子一样的黑色人形突然出现的“影子男”，特定的人陷入异常心理的“狐妖”等，两人组成搭档，挑战用现代科学常识无法考虑的异常现象。
这季将讲到原作小说第5-9本的内容，也将“比第一季更复杂、野心更大”。紧接上季结尾，三姐弟被银行家Poe寄存在普鲁弗洛克预备学校，等待合适监护人，他们会遇见奇葩的同学Carmelita Spats。而尼尔·帕特里克·哈里斯饰演的大坏蛋欧拉夫伯爵，会伪装成欧洲拍卖商Günther来到学校。
民国十四年以后，从英国留学归来的纨绔公子路垚（胡一天饰）凭借其超高智商和推理能力，被身手不凡的巡捕房探长乔楚生（张云龙饰）邀请做探案顾问，之后二人又携手正义感爆棚的女记者白幼宁（肖燕饰）组成侦探小分队，侦破了一个个看似诡谲蹊跷的命案，性格迥异的三人在乱世中坚守着正义，维系社会安定的传奇故事。
故事开展於清乾隆三十五年，正值乾隆六十大寿，一片太平盛世的景象。可是在故事的主要舞台，广州南屏县，气氛却异样地沉重，仿似如临大敌。上至两广总督，下至九品芝麻官却是人人自危，严阵以待。一切，就始於一场官史与状师的对决。眾官的对手，正是专门与官府为敌的荒唐状师，方唐镜。眾官员收到消息，方唐镜不日便会南下到广州。眾人商议后，决定将应付方唐镜之事交由九品芝麻官纳兰耿负责，只因纳兰耿的县衙有一秘密武器──他的女儿，人称玉面罗刹的纳兰青青。青青出生於官宦世家，父亲乃旗人，本为武状元出身，胸无点墨，青青受亡母嘱託，熟读律法，在背后助父断案判案，结果她做得比男子更好，让其父赢来不少名声，只有少数人知道，功劳归於背后的青青。青青为助父亲，平日无閒料理家务，无法过寻常女子生活，更耽误婚嫁，加上青青对男性要求甚高，更让婚期遥遥。
