前一世，丹圣秦逸尘虽然拥有着冠绝大陆的丹术，名震天下，但却因为武道造诣平庸，只能眼睁睁的看着仇敌欧阳昊天夺了自己爱人风千雪的武魂，在自己眼前杀了风千雪和他的兄弟澹台朔。
美术大学学生竹本和学长真山以及多次留级的森田一起生活在单身公寓里，大家的生活风清云淡却也乐趣无穷。
松田启人（津村真琴 配音）是一个热爱幻想的五年级男生，一次偶然中，启人捡到了一张神奇的卡片，这张卡片将启人带往了生活着数码兽的数码世界，在那里，启人遇见了基尔兽，此时的他并不知道，基尔兽将会是他一生中最重要的搭档和朋友。为了保护数码世界和数码兽，四圣兽之一朱雀兽接连不断的将帝魔送往人类世界，造成了危险和混乱，启人和好友牧野留姬（折笠富美子 配音）、李健良（山口真弓 配音）一起为了保护和平加入了战斗之中。不仅如此，朱雀兽还带走了掌握着数码兽进化关键的古乐兽，追随着古乐兽的踪迹，启人一行人闯入了数码世界，展开了大冒险。
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万族时代，为争夺更多资源，不同种族之间互相争斗，甚至不惜掀起大战。在血雨腥风和尔虞我诈的时代里，随着古人族消失在历史长河中，新的人族踏着鲜血崛起，为了生存而战......
