为拯救身患绝症的妈妈，不孝子董璀璨和神秘人签订“契约”，用自己的时间换回了濒临死亡的妈妈。痊愈后，妈妈严锦玉不仅变回了20岁时、身体尚还健康的状态。还依靠着自己超越“同龄人”的成熟、乐观，活出了曾经不敢想象的、更精彩的人生。然而，另一方面，董璀璨为了不让妈妈担心，隐瞒了生命的真相，独自背负起了契约的代价。并决定在生命最后的时间里，弥补曾经的遗憾、报答妈妈的养育之恩……
位于东京西部的巨大“学园都市”。在总人口达230万人，其中约8成是学生的这座都市中，实施着超能力开发的特殊课程，学生们的能力被给予从“无能力Level 0”到“超能力Level 5”的六阶段评价。在这样的学园都市君临能力者顶点的最强能力者·一方通行。他在仅有7人的“超能力者”当中也以远超其他人的能力位居第一，也因为这种力量而过着充满杀伐的日常。不断重复、脱离常轨的“实验”，以及在追求绝对力量的最后品尝到的败北。在那之后，随着与一位少女——最后之作的相遇，他的命运产生了巨大变化。最强而最凶的“恶”——一方通行，扫平学园都市的“黑暗”!
