穆德（David Duchovny 大卫•杜楚尼 饰）被外星反叛者劫持，而斯科莉（Gillian Anderson 吉莲•安德森 饰）亦同时发现自己怀有身孕，穆德的办公室被搜查，斯科莉请求Skinner（Mitch Pileggi 饰）帮助寻找搭档，孤枪侠也参与进来。FBI高层则派出探员约翰•多格特（Robert Patrick 罗伯特•帕特立克 饰）协助调查，但两个人的初次会面不欢而散。
史达车祸之后对熟悉的环境感到不适应，回快递站上班也是各种被投诉，忍不住联系女朋友夏梦瑶，去夏梦瑶公司示爱，夏梦瑶告诉史达他们已分手。史达被人围堵，被迫动手收拾夏大伟几人。史达顺着少许线索调查，知道自己车祸当天有工业园发生爆炸，他来到工业园寻找线索却遇袭。夏大伟强行让史达签下欠条，夏梦瑶撞到史达被夏大伟绑架，将史达带走。史达再次求复合被拒，心灰意冷之际易枝花打电话怒骂史达，史达只得赶紧去送货。
少女玛丽·阿德勒（凯特琳·德弗饰演）报警说自己在家中被一名闯入者强奸，但调查人 员以及她身边的人都怀疑这件事的真实性。与此同时，在数百里外，侦探格雷丝·拉斯马森 和卡伦·杜瓦尔（分别由艾美奖获得者托妮·科莱特和梅里特·韦弗饰演）在调查两起非常 相似的强奸案时相遇，她们合力追捕这名潜藏的连环强奸犯。
该剧讲述刑警和刑警的恋人，以及杀人魔，这三个人32年前因为恶缘结束了生命，但死并不是终点，而是打开了新的大门。32年后他们分别转世成检察官、考古学讲师、医学院学生，因为强烈的缘分和恶缘再次纠葛在一起。
1996年，新泽西州高中的一支名为“黄蜂”的高中女子足球队前往西雅图参加全国锦标赛，她们乘坐的私人飞机在飞越加拿大时不幸坠毁在无人荒野的深处。幸存下来的队员最终在野外生存了19个月。25年后，承受着身心创伤的幸存者们发现当年在荒野发生的事情远远还未结束。
