《闪耀月亮女王》故事中，追溯了一位年轻才华横溢的歌手和舞者宁雪艳的奋斗经历。作为学校里的佼佼者，她深受同龄人的羡慕和赞誉。尽管她的母亲曾是第一代月亮女王，但由于在成长过程中未曾得到母亲的陪伴，宁雪艳只能依靠自身努力，力争成为月亮女王。
继《迪迦奥特曼剧场版:最终圣战》的故事时间之后火星移民计划启动，人类纷纷登陆火星和其他领域。新的GUTS——SUPER GUTS成立了，并替代了原GUTS。 转眼间7年过去了，人类取得了巨大的突破，开始了对多种未知世界的开拓。地球人怀着单纯的憧憬以及无限的探求心，向太空进发，人们将此称为新领域的时代。但与此同时，一些新的可怕力量也都苏醒过来。 本作的主人公飞鸟信，是在光中消失的宇航飞行员飞鸟一马的儿子。当时的飞鸟信还和他的父亲约定回来看他打棒球，在此时他却从戴民长官那里得知了噩耗。
