9岁男孩马丁是一名小学生，由于误食了特殊药物，马丁发生了奇特的变化。每天早上马丁都会变成一个不一样的人，他会变成力大无比的超人，又或者会变成小龙人、变成国王、变成外星人、变成侦探、变成机器人，变成魔法师，变成老巫婆，变成吸血鬼等等。由此而引发出了一个个有趣的故事。
佐久间凛子是在芥边侦探社工作的女大学生。她的雇主阿久田边发现了她的才能，当她作为他的助手满足他的要求时，她了解到了阿久田边作为“魔鬼侦探”的秘密一面。
所谓的“除妖”，即是把由于某些缘由而从原本应在的“隐世”来到“现世”停留的妖怪们送回“隐世”这一工作。某天，被妖怪附体的高中生·芦屋花绘，依靠偶然发现的联络方式，来到了专门除妖的物怪庵，在那里的是一脸不高兴的店主安倍晴斋。由于某些缘故，芦屋就这样以物怪庵奉公人的身份开始工作……安倍与芦屋的除妖组合和妖怪们的物语就此开幕。
