150年前，世界迎来末世，所有城市变成废墟。灾变后，生物发生未知的进化，被称为妖兽的怪物遍布世界，人类被迫建立起一座座基地城镇得以生存，而拥有各种对付妖兽能力的镖师成为新世界中连接人类聚居地的重要存在。少年陆仁伽为了调查师兄死亡的真相成为了镖师，活跃于东南片区，在历经镖局任务的各种冒险后逐渐接近真相……
奥斯特拉尔岛，位于萨摩亚群岛东南2000公里处。为了揭开这座已被地图抹去名字的岛屿的秘密，田上悠追随已故父亲的足迹，踏上了一段冒险之旅。在父亲的朋友威尔博士、妹妹多丽丝以及威尔自称“船长”的朋友的帮助下，悠前往岛屿，却遭到巨型企业“盖尔”和由猞猁夫人领导的“美洲狮帮”的追捕。就在悠和他的伙伴们终于抵达岛屿时，他们突然遭到一只神秘怪物的袭击。正当他们看似绝望之际，一个巨大的蓝色机器人出现，摧毁了怪物，救下了悠。尽管这是悠第一次遇到超越人类理解的存在，但他却感到一种莫名的温暖和熟悉感。
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讲述中国人自己的校园生活，继1、2季之后又增加了很多有趣的新角色，时长大大增加让情节更生动完整。师生之间，同学之间爆笑又带着温情的一个个故事，带你回到充满快乐简单的初中时代！
前作中以三号机驾驶员巴武藏的牺牲为代价，终于打败了恐龙帝国，但又出现了由有角人类构成的百鬼帝国也要征服世界。补充了新驾驶员車弁慶及新机器盖塔G的早乙女研究所又投入了战斗。
