有 230 万人口，其中八成人口为学生的「学园都市」，是比其他地区科技更为先进，并从事「超能力开发」的特殊地区。而整座学园都市中仅有七人的等级 5 超能力者之一御坂美琴，由于她的能力与个性使然，因而被卷入了学园都市中所发生的种种事件……
卡牌游戏骤然降临地球，外来玩家化身普通人潜藏都市，彼此厮杀争夺强力卡牌。孤女风翎意外觉醒专属超能力，因天赋潜力超群，被游戏系统标记为隐藏终极 BOSS。各方玩家接踵而至，都想要击败她夺取力量。绝境之中，风翎不再被动躲避，凭借自身能力奋起反击，守护自己的同时，试图打破这场笼罩世界的残酷游戏。
