曾经的一场人魔大战令两方人马都元气大伤，如今，战争的硝烟已然散去，却遗留下了诸多的难题要一一破解。人类为了赢得战争而锻造了大批拥有强大力量的武器，人们称之为“神诲魔械”，战争结束后，这批破坏力强大的武器的去向则成为了需要解决的首要问题，大家都同意将它们交由护印师来保管。
故事地点设立在平行宇宙的现代社会。在这个大环境背景下，所有人的手机上突然出现了一款末日游戏，而在末日游戏出现的十分钟后，游戏入侵现实，末日降临。 《末日游戏》是一款极度氪金的游戏，只要氪金，就能从各方面提升游戏中的角色数值。 一开始，并没有人把这款游戏放在心上，所有人都只来得及创建角色，但只有身为重生者的主角赵铭知道，这款游戏将会在一段时间后入侵现实——也即是游戏中的一切都会逐渐映照在现实中，包括玩家创建游戏角色的各项数值！ 换而言之，只要在游戏入侵现实之前将钱充进游戏，那么在游戏入侵之后，这些钱就会成为赵鸣最大的依仗！ 因此，赵铭开始大氪特氪，最终在游戏入侵现实之前将自己整整一个亿的现金氪进游戏中，并且获得氪金奖励，获得唯一一次职业【炼金术师】。 依靠炼金术师的能力和游戏开始前氪的一个亿，赵铭在这个危险的末日之中直接无敌，最终弥补了前世的遗憾，并且终结了末日。
本作品讲述的是以世界最大的视频投稿网站“NewTube”为舞台活动的“NewTuber”们的少女喜剧。
《明日方舟》衍生迷你剧《鲤氏侦探事务所》将于2022年12月23日19:00正式上线
