三剑客成功拯救完水果世界后,由于在花果山大合唱庆祝胜利造成第七层的崩塌,直接伤害到七色彩莲。为求保住彩莲,东方求败被外人蛊惑利用,接受了人类世界的忍术和其他技术去抢救彩莲,但同时也成为了拐带水果们的帮凶。方丈与果姥上山探望东方求败,无意间看出当中端倪,东方求败有灭口之意。三剑客赶到之时,方丈与果姥为保存实力,不单一个装疯扮傻,一个诈死,还出狠招将三剑客打落悬崖,并且疯言疯语,让众人误会三剑客,促使三剑客再无立足之地,必须远走他乡,从而避开东方求败的迫害。
龙墟界域,广袤无垠,宗门林立。羽神宗独占东方一隅,传承了无尽岁月,强者无数,难以撼动。门中设有天灵院,搜罗各处的天才少年加以培养,为宗门不断输送掌握妖兽力量的妖灵师。少年聂离,由羽神宗外门执事引荐,前往天灵院修行。在天灵院,聂离与神秘少女应月茹相遇。少女掌握了能够演算天机的天衍禁术,预感到羽神宗将会在各大家族的争权之中走向分崩离析的结局,而怀有赤子之心的聂离就是唯一能阻止这一切的天选之人。两人因此成为师徒,聂离必须在应月茹的指点下一步步登上羽神宗宗主之位。
动画在原作基础上把时间轴转移到了六胞胎已经成年后的背景下。然而他们却一如既往地选择了家里蹲,每天过着无所事事的日子。作品在维持了原作风格的同时,大胆融入了各种NETA和现实要素。
斯派罗试图证明自己像其他 Skylanders 一样拥有超能力,但当他们陷入危险境地时才意识到自己的力量。