在一个名叫企鹅村的所在，生活着一群脑筋秀逗但无比快乐的人，他们热衷做一些无厘头且看起来很傻的事，浑然不觉而乐此不疲。村中还生活这一个绝顶聪明的男人，名叫则卷千兵卫。某天，博士发明了名叫阿拉蕾的机器人，阿拉蕾天真无邪，力大无穷，时不时会把地球劈成两半，把企鹅村闹得天翻地覆。随着阿卡的到来，具有超强破坏力的组合更让博士胆战心惊，头疼不已。此外，傻瓜超人，外星大魔王也给企鹅村的各位带来别样的体验与乐趣。阿拉蕾，快乐的小女孩和她的朋友们为世人奉上了无限难忘的回忆。本片根据漫画家鸟山明的同名原著改编。
故事的地点发生在这个整年都会不可思议地开着樱花而出名的新月型岛--初音岛。梦幻的初音岛上发生了不可思议的现象，本不会枯萎的樱花在一夜之间突然枯萎了。两年之后，樱花再度在初音岛上绽放。主人公朝仓纯一进入风见学园，继续过着校园生活。他的口头禅“好困”消失了，变成了勤勉努力，热衷体育的开朗青年。此时，他的两个妹妹，两年前离去的朝仓音梦..
天才少年古云，因为被上古神族中下神印，导致灵力减弱，成为青山门公认的废物，被贬为杂役。父亲因此被牵连，废除族长之位，囚禁在敌人飞卢家族的天牢里。这时古云发现了自己身上隐藏的秘密，并且跟古神达成合作协议。
