《康熙微服私访记2》沿袭该剧借古讽今、针贬时弊的新派古装轻喜剧作品风格，分为“馒头记”、“桂圆记”和“霞帔记”三个单元故事组成。“馒头记”里讲述康熙五十年，康熙（张国立饰）正值微服私访时居然被当地豪强骗进金矿做苦工；“桂圆记”发生在康熙五十一年，康熙抱病，宜妃（邓婕饰）让三德子（吴军饰）请太医为其诊治，病情反而加重。原来都是假药作祟，康熙愈后出宫，严惩不法之徒；“霞帔记”里讲述康熙五十二年，康熙大义灭亲，整治裙带关系。
武馆女掌门黄小鱼作误闯娱乐圈，意外成为当红明星袁帆的贴身保镖，正式开始甜喜过招的同居生活。黄小鱼也向袁帆坦白了自己被大热武侠游戏《新斗罗大陆》NPC附身的秘密，开启了一段游戏和现实双线开恋的高甜时光。
