沐浴后能致死的剧毒之雨“Blue Cyst”所导致的大灾难“新月之泪”。在那之后经过100多年的时间，人类终于开始走上了克服这一灾难的道路。在荒废世界的村落“Nest”中坚强生活的人们身边，发现了搭载类双对思考型AI的类人“梅加斯”的身影。
社会在“前所未有的大灾难”的冲击下持续动荡不安。住在东京的青年浅野铃四郎有一个难以启齿的秘密，就是他可以暂停时间的流逝，拥有停止时间的力量。直到有一天，浅野铃四郎遇到了拥有同样超能力的少女桥本荠，并在得知桥本荠的能力被利用于犯罪行为后，冲动地帮助了身陷囹圄的她……
最坏的恶棍组成的致命疯狂派对降临 异界 ！！！
藤原拓海由于不败的战绩，必然会受到新的挑战。《头文字D》的第二部着重突出拓海的成长，当然不乏激烈的挑战。最经典的要数赤诚和依吕波山路两位老大的比拼。年轻的拓海在爱情上触了礁，在输给帝王车队的lanEvo 3后，拓海遇到了人生的挫折，对自己和AE86产生了怀疑，AE86真的有足够的实力吗？AE86的重生来自拓海的爸爸文太，他为AE86改装了赛车用引擎。同时，拓海遇到了同样是AE86的强劲对手秋山涉。有意思的是比赛规则是在同一赛道两车来回追赶，直到其中之一能超越对方为止，既要技术又考耐力。胜利让拓海继续接受这辆AE86和重拾信心回到车手的生涯。
根据广受欢迎的短片和漫画改编的《氰化物与幸福》节目来啦！节目中展现了普通人各种滑稽搞笑的举动。无论是安全带命令某人开枪射击，还是制作热狗的外星机器人，他们都能做到！
萧羽重生得知T病毒将席卷S市，丧尸还会持续进化，常规躲避方法失效。绝境中他意外激活系统，击杀丧尸可组建“职业女神战队”。萧羽救下安小冉，成功激活系统后战队成立，二人发现系统空间可共享，便开启疯狂囤货模式，从商场仓库到屠宰场一路扫荡。
