在古老的剑域大陆上，有着十柄神剑和五大家族，五大家族之一的吕家后代吕阳在逃避追讨的危机时刻觉醒神剑“桃神剑”，为躲避追杀，他韬光养晦，刻苦修炼，为母报仇，探寻真相，在各大家族势力间争斗斡旋，最终称霸天下十剑，问鼎剑域大陆。
所谓的“交流障碍症”——
魔法——這不是傳說或童話的產物，而是發展至今將近一個世紀的現實技術。今年春天，持有施展魔法能力的「魔法師」培育機構「魔法科高中」，某位少女將入學就讀。容貌秀麗、完美無缺的優等生——她的名字叫「司波深雪」。深雪夢想著和一同入學的哥哥——達也過著親密的高中生活，但擋在她面前的是一科生與二科生——優等生與劣等生的高牆……!? 由愛慕哥哥之心更勝親情的妹妹——深雪的視角所鮮活描繪的，另一個「魔法科高中」在此上演。
