炎刚、孟泽、辰天三人与背负旧恨的青木、金磊、玄冥在城市废墟间爆发激烈冲突，身受重伤的依莎却在关键时刻苏醒，但此时的依莎体内寄宿了阴之神骸的化身——白曬。白曬阐述了阳之神骸“腾蛇”正在被异种意识侵蚀的状况，以及Y组织正在执行的可怕计划——开启七处上古遗迹，释放被封印的凶兽。以炎刚为首的主角团不得不与时间赛跑，一边阻止Y组织逐一解开遗迹的行动，一边应对接踵而至的凶兽危机，并在战斗与对峙中逐渐解除与玄冥之间的误会，玄冥也将直面内心的挣扎，找回向往光明的本心。本季通过一连串惊心动魄的守护之战与感人至深的情感救赎，深刻探讨了如何肩负个人责任与团队使命守护正义的主题，展现了超人们在绝境中成长、在黑暗中追寻光明的正向精神，给观众传达积极向上的正能量。
苏临晚穿越成臭名昭著的稀有向导，原主以摧残哨兵精神力为乐。她连夜逃出基地，只想在荒星苟活。可那些曾被伤害的哨兵却一个个找上门，眼神再没了恨意。她用耐心与善意帮他们安抚精神体，没想到这群桀骜不驯的“疯批大佬”全乖了。她叹气：我只想苟活，怎么就成了全星际最野的驯兽师？
鱼住陆生（小林亲弘 配音）是一个无论是长相还是性格都非常普通的男人。大学毕业之后，陆生并没有削尖了脑袋想要挤进大企业里，而是选择去便利店成为了那里的一名打工人，所有人都对陆生的选择表示不解，但陆生脑中有着他的算盘。森之目榀子（花泽香菜 配音）在一所高中里担任代课老师的职务，因为曾经的一段悲惨经历，导致榀子紧紧的封闭起了内心，不再接受任何人的关怀。陆生喜欢上了这样的榀子，默默的守候在她的而身边。野中晴（宫本侑芽 配音）是早早就离开了家走上了社会的早熟少女，在机缘巧合之下她喜欢上了陆生，并且知晓了他对榀子的感情。
有马一花（小坂井祐莉绘 配音）是一名平凡的女子高中生，一天，在地铁站里，她遇见了因为低血糖而差点摔下楼梯的上班族天草亮（丰永利行 配音），善良的一花将自己的便当送给了亮，被一花这一举动深深的感动的里亮瞬间坠入了爱河之中，并且在隔天就对一花展开了热烈的攻势。天草理绪（长谷川玲奈 配音）是一花的同学兼好友，巧合的是，亮竟然就是她的哥哥。从理绪那里，一花得知亮是一个非常轻浮的男人，这无形之中给亮追求一花增加了难度。多丸快（榎木淳弥 配音）一直默默爱慕着一花，在亮这样一个成熟又强大的竞争对手面前，多丸会做出怎样的回击呢？
