主角就读于私立学校“私立天堂学院”。蓝天日み和星川み月。Himari 的梦想是成为 Aipri......结交 10,000 个朋友！但在陌生人面前害羞又紧张的 Himari，可能有点困难...现在 Himari 竟然和 AiPriii 一起首次亮相！？我甚至不能告诉我最好的朋友Mitsuki“秘密”已经揭晓！不过，Mitsuki 也有一些似乎有一个“秘密”……怀揣着秘密的Himari和Mitsuki开始了他们的AiPri关系！！
魔法——這不是傳說或童話的產物，而是發展至今將近一個世紀的現實技術。今年春天，持有施展魔法能力的「魔法師」培育機構「魔法科高中」，某位少女將入學就讀。容貌秀麗、完美無缺的優等生——她的名字叫「司波深雪」。深雪夢想著和一同入學的哥哥——達也過著親密的高中生活，但擋在她面前的是一科生與二科生——優等生與劣等生的高牆……!? 由愛慕哥哥之心更勝親情的妹妹——深雪的視角所鮮活描繪的，另一個「魔法科高中」在此上演。
