邪恶头目吞天派遣手下混沌入侵地球，夺取盘古之力。地球最后的守护者——巨神守卫登场迎战却受重伤，临危之际，巨神守卫把自己的力量赋予五位面对危难依然勇于助人的少年。 混沌虽伤重败退，却在吞天的帮助下获得蛮兽卡。东山再起的混沌回到地球，通过引诱拥有负面情绪的人类，让其与蛮兽卡结合变成强大的蛮兽为己所用。虽然吞天一伙看似不可战胜，但少年们组成的巨神战击队坚信自己能挑战不可能，驾驶各具威力的机兽与邪恶力量抗争到底。
迷你特工队的战士福乐失忆后来到了名为丛林岛的地方。在这里，他和超威战队的伙伴们并肩作战，对抗利用黑暗能量精灵占领丛林岛的火花军团坏蛋们，开启了守护正义的新征程！在丛林岛生活的超威战士们面对火花军团的侵占，敢于团结反抗邪恶的无畏行为，真切地传达着善良正直的力量。同时，福乐与新朋友一起进步成长为优秀的战士，也在教导小朋友们要真诚友善地与人 相处，用积极向上的态度面对新环境、新挑战......不仅如此，《迷你特工队超威能量》通过动画中绿色能量和城市环境的好坏紧密相连的设定，向小朋友们生动地阐述了保护生态环境是 与个人息息相关，要树立正确的环保意识，为大自然贡献属于自己的绿色能量。
故事描述女主角小樱（木之本樱）与男朋友小狼（李小狼）和其他同学从小学毕业后升上初中的故事。在一次小樱做梦梦到53张樱之卡上面的图案都消失了，一名神秘人物出现之后库洛牌都碎掉了，小樱从这个梦醒来翻开封印之书发现库洛牌都变成透明的了!在与知世、小狼和艾力欧的讨论下，小樱重新踏上了收集透明牌的故事。
