在一个充满超能力与可怕危机的世界，是超级英雄守护着世界的安定。而从出生就被判为无能力者的周舜天，非常渴望成为拯救世界的英雄。在一次意外中，他无意间获得了与超能力完全不同的力量，从此成为另类英雄的他，用自己的方式守护着世界，保护着家人和伙伴，但在他身上，似乎还隐藏着不为人知更大的秘密……
乔纳森·乔斯达与DIO决战后的一百年，DIO复活了。同时，乔瑟夫的孙子，空条承太郎发现自己有幽波纹（替身）能力，DIO的复活影响了没有替身抵抗能力的母亲，陷入病危情况；为了拯救命在旦夕的母亲，承太郎与乔瑟夫出发前往DIO的所在地——埃及。
故事发生在巡之丘学园中，丈枪由纪（水濑祈 配音）天真可爱，是名副其实的开心果。惠飞须泽胡桃（小泽亚李 配音）踏实可靠，她的坚强和元气影响了身边的每一个人。若狭悠里（市道真央 配音）温柔坚强，是大家心目中稳重的靠山。直树美纪（高桥李依 配音）外表冷漠，但内心的热情不容忽视。这些可爱的孩子们共同组成了“学园生活部”，每天都在进行愉快的部活。
