藤沼悟（满岛真之介 配音）拥有着能够回到过去的特异功能，母亲佐知子（高山南 配音）被害，曾经信赖的朋友白鸟润（水岛大宙 配音）即将作为儿童连续杀人案的真凶被处以死刑，在这个节骨眼上，悟忽然回到了1988年，回到了当时就读的小学。
佐伯丽奈（原奈津子 配音）是一名平凡的高中二年级女生，个性十分开朗活泼的她对世间的一切都充满了浓重的好奇心。朝比奈凉香（藤田奈央 配音）是丽奈的同班同学，一头利落短发的她，性格像男孩一样大大咧咧，不仅运动神经非常发达，成绩也常年霸占年级第一名的宝座。五十岚琉璃子（徳井青空 配音）是丽奈青梅竹马的玩伴，沉默寡言时常放空自己的她实际上拥有超强的灵感力，常常能看见别人看不见的东西。
美星、小月、菲洛三位魔法少女历经环境与人事变迁后，各自走上截然不同的职业道路。这时，由王子所建立的“星阁”正好面临着重组王国王庭的局面。却不料，重组过程中各方势力纷纷展开波诡云谲的斗争，美星、小月、菲洛在家族与权威力量的影响下，被卷入这场角逐，不得不为各自家族的利益而明争暗斗。最终她们在无止境的斗争中寻回真挚的...
