在科技发达的未来，网络上流传着一种真假不明、被称为“全息幽灵”的奇怪现象.初中一年级的天之河宙，启动了父亲留下的“数码暴龙机”开始能看到大家看不见的未知生物“数码宝贝”......
该剧主要围绕于愤世嫉俗的疯狂科学家瑞克·桑切斯和他容易受挫折的外孙莫蒂·史密斯在自己的生活和其他异空间穿梭的奇妙冒险。
故事发生在彩玉大学的理科研究室内，冰室菖蒲（雨宫天 配音）和雪村心夜（内田雄马 配音）是在这里工作的两名研究生。某日，让心夜没有想到的是，自己竟然收到了菖蒲的告白。所为万事以科学为上的理科研究生，对于爱情自然也要用符合逻辑的证据去证伪，为了证明菖蒲对自己的爱确有其事有迹可循，心夜带领着整个实验室开始了对爱的实验。每天都像佣人一样被使唤来使唤去的解说员奏言叶（原奈津子 配音）、性格反复无常，过于以自我为中心的棘田惠那（大森日雅 配音）、表面看来是个不良少年，实际上却是个死宅的犬饲虎辅（福岛润 配音），陪着菖蒲和心夜进行爱情实验的是这些可爱的研究员们。
栗原海里（和气杏未 配音）是一位非常善良的高中生，因为在所有方面都比别人强一点点，所以海里的高中生活过得并不是那么的顺利，周围的人总是和她保持着距离，这让海里倍感孤独。一场意外中，海里遭遇了事故，转生来到了异世界中，她向神明许愿，希望在这里自己能够成为一个所有数值都是平均值的普通少女。
陆瑾年和乔安好在初三的那一年，因为一场雨相识，两个人互生情愫，可是每次却都阴错阳差的错过。晃眼过去八年，陆瑾年，终于在演艺圈里混的有了起色，准备在乔安好生日的那一晚去找她告白。又因误会而失败。五年后，韩如初找了陆瑾年来扮演许嘉木，然后并放出和乔安好联姻的消息，企图以稳住家族企业，曾经互相暗恋的两个人，再次重逢，并开始扮演假未婚夫妻。两人的关系却因之前的误会处于冰封状态。直到陆瑾年两人互相坦露心迹，重修旧好。两人的感情因一次又一次的误会和旁人的阻隔而生隙，直到最后乔安好知道真相……
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