年仅七岁却超速生长的短命神童时江，为恢复正常生活，带着寄宿体内的某位大神仙闯入仙界，从此在异世中和神仙们斗智斗勇，走上成为仙界大亨的传奇之路！
前作中以三号机驾驶员巴武藏的牺牲为代价，终于打败了恐龙帝国，但又出现了由有角人类构成的百鬼帝国也要征服世界。补充了新驾驶员車弁慶及新机器盖塔G的早乙女研究所又投入了战斗。
曾经，世界面临着被称为「邪龙」的邪恶存在所毁灭。
城市中出现了来历不明的光病毒。 SRC中的Eyes队成员为要确认光源搜寻至镝矢岛，遇上了对怪兽充满爱心的预备飞行员春野武藏。此时，光病毒入侵怪兽力特里亚斯体内，力失控，Eyes准备向力发动攻击，武藏决要阻止，危急中，超人高斯终于回来。
一觉醒来，夜北发现自己复活了，并意外获得一个寻回全部失落弟子的使命！时间已经过去整整三百年，夜北踏上征途，不顾艰辛，逐个寻回弟子，辛辛苦苦培养弟子们长大成人，一路共克艰难，面临危机迎难而上，拯救天下正道苍生
