曾经灭亡的死者之街，那里有一个孩子和三个不死的人。被曾经作为英雄的不死者们养育的少年。继承技能继承知识，注入爱的少年成长。阐发了下去，不死者的过去，奥秘的谜。当知道那一切的时候，少年踏上了通往圣骑士的道路。一个温馨和带有伤感的故事
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未来世界，人类开始向宇宙移民，建造了名为”ネクスト”的殖民卫星，但不久地球和殖民地间的矛盾激化，人类分成ネクスト同盟军、地球政府军和地球革命组织三大阵营相互杀伐，而战争中的主导兵器则是名为”MV（Metal Vehicle）”的人型机动兵器。主人公ジェイストライカー原本是ネクスト同盟军的MV驾驶员，由于厌倦了战争而和其他同样厌倦战争的人一起在殖民卫星ネクスト7落草为寇，专做打家劫道的营生，有一天却卷入了神秘超兵器”S.A.C”的争夺战中。
故事的舞台是互联网系统发达的都市「DEN CITY」。在那里有经由巨型企业「SOL技术社」通过高度的网络技术构筑而成的被称为「LINK VRAINS」的VR空间。人们都在那个VR空间中为体验到全新的决斗而狂热。可是在「LINK VRAINS」中却出现了利用决斗来进行黑客行为的谜之黑客集团「海诺因骑士团」。而他们的目标是将存在于互联网的某处的“AI们的世界=电子界”毁灭。然而在世界受到这样的威胁时，有一名决斗者站了出来。而他的名字正是「Playmaker」。在那场传奇的战斗中，「Playmaker」使用压倒性的决斗将「海诺因骑士团」打倒，成功捕获了「SOL技术社」和「海诺因骑士团」都想要得手的迷之AI程序。一度拯救了世界，然后却突然消声匿迹了，而他的名字就在互联网的世界中一瞬间变得声名远播，成为了传说。而现在，作为「Playmaker」的正体的某位高中生藤木游作，为了寻找过去发生的某件事件的真相，对再次在「VRAINS」出现的「海诺因骑士团」展开了追击...... 以此为契机，命运的齿轮就此转动……迷之AI的真身，「海诺因骑士团」盯上「Link Vrains」的目的，以及隐藏在游作过去的真相到底是———所有的答案，都在「Link Vrains」中
